Важнейшей составляющей любого сайта является навигация (navigation) – система переходов между документами сайта. Навигация дает пользователю представление о структуре сайта и возможность перемещаться к нужной странице. От того, насколько она продумана, удобна и понятна посетителю, сильно зависит вероятность отыскать нужное и желание вернуться. Для e-commerce площадок, располагающих не только какими-то страницами с обобщенной информацией, но и объемными каталогами товаров и услуг, вопросы правильной организации навигации по каталогам имеют первоочередное значение.

При организации такой навигации могут браться за основу различные принципы (типы) классификации товаров и услуг (см. Типы навигации и классификации). В качестве навигационного интерфейса могут применяться различные визуальные элементы и приемы отображения информации (см. Средства навигации и навигационные интерфейсы). С учетом постоянного роста вычислительных мощностей и скрости обработки данных, в навигационных интерфейсах все чаще присутствует множество динамических элементов, автоматически подстраивающихся под потребности конкретного пользователя (см. Персонализация и «умная» навигация). 

Для улучшения пользовательских характеристик коммуникационных интерфейсов и повышения их «продающих» свойств вместе с персонализацией навигации e-commerce площадки реализуют специальные решения, которые позволяют предугадывать и направлять весь путь движения (среду взаимодействия) посетителя/пользователя по сайту, сокращая ненужные шаги и предлагая подходящие для данного посетителя цели и альтернативы (см. Оптимизация среды взаимодействия с пользователем).